极力拼出口、拼观光的日本，在这时候爆发禽流感，这是日本3年来再度陷入禽流感的恶梦，这次疑似集体感染H5型禽流感的地点在九州的熊本县，为了杜绝后患，日本政府除了立刻扑杀11万只鸡，同时立刻禁止半径10公里内的鸡只、鸡肉和鸡蛋交易；日本对禽流感是戒慎恐惧，完全不敢掉以轻心，因为3年前最严重时，蔓延了日本，9个县全传出疫情，这次的九州熊本饲养的鸡只超过350万，数量占日本全国第8。
日本熊本县的养鸡场爆发禽流感，在附近国道行经的车辆通通被拦检消毒。消毒人员：「因为禽流感的关系，正对车轮进行消毒。」
司机：「很担心，没想到会在本地发生（禽流感）。」
熊本县多良木町的养鸡场，56000饲养鸡只当中，有1100只死亡，经检验，10只有2只感染H5型禽流感，为避免疫情扩散，14日已对同个业者经营的2个养鸡场，合计11万2千鸡只，全面进行扑杀，预计周三前（16日）直接在养鸡场内完成掩埋。日本首相安倍晋三：「要彻底并迅速执行防疫对策与防疫措施。」
这是日本3年来首度在国内发现禽流感案例，尤其目前是东南亚候鸟迁徙至中日韩的季节，南韩过去3个月就因为鸡、鸭大规模感染H5N8，1100多万鸡、鸭遭扑杀，所以不排除是候鸟将病毒带进日本。京都畜产大学禽流感研究所大衬公一：「可能是在中国、东南亚感染了病毒，或是大量病毒附着在鸟类身上，让病毒入侵养鸡场。」
H5型禽流感中，以H5N1最为人知，至今已在50多国间流传，日本也偶有疫情，3年前在宫崎、千叶等9县，曾因此180万只鸡遭扑杀，不过这回的H5型疫情只出现在熊本县内特定养鸡场，而且不会传人，但为了防疫，熊本县府发布，在爆发疫情的养鸡场半径3公里内，禁止鸡只与鸡蛋移动，半径10公里内的鸡只与鸡蛋也禁止交易。熊本县养鸡业者：「因为发出移动限制，所以非常地困扰，但希望疫情不要扩大。」
素有「畜牧王国」封号的日本南九州，除了禽流感，还有另一个情况堪忧的传染病，PED猪流行性腹泻，病毒透过粪便传染，感染猪只会有食欲不振、腹泻等症状，又以出生10天的猪仔最容易发病死亡，自去年10月冲绳首度发生感染案例后，疫情迅速扩散，截至目前已知26个县，19万头猪感染、5万8千头死亡，数字还在不断增加。日本主妇：「还满常吃猪肉的，一个星期大概吃3次，所以很常买。」
日本主妇：「常煮姜烧猪肉、饺子，咖哩也喜欢猪肉口味，还有炒菜也用。」
日本全国共有1700万头食用猪，虽然疫情目前尚未影响到市场猪肉价格，但与2010年中国大陆、2013年美国发生的猪流行性腹泻病株类似，如何从海外传入日本，原因尚不明，其实就连台湾也中标，疫情至今传了半年，20多万头猪死亡，猪肉价格居高不下。动物卫生研究所山川睦：「病毒本身不会传人，所以不会对人的健康造成影响。」